Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms