Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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