Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms