Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gm27235Q3UW50 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm27235Q3UW50 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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