Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3b2Q3UJB0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3b2Q3UJB0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms