Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms