Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms