Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms