Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NrepQ07475 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms