Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdx4Q07424 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms