Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms