Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms