Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Scn1bP97952 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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