Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

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Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcc1P97496 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcc1P97496 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcc1P97496 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcc1P97496 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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