Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SbdsP70122 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms