Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CgnP59242 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CgnP59242 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CgnP59242 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CgnP59242 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms