Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CtswP56203 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CtswP56203 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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