Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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