Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtpreP49446 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtpreP49446 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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