Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtlP38585 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms