Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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