Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms