Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NelfeP19426 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NelfeP19426 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NelfeP19426 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NelfeP19426 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NelfeP19426 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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NelfeP19426 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NelfeP19426 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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