Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms