Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01661 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01661 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01661 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01661 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01661 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01661 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01661 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01661 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01661 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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P01661 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01661 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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