Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vamp4O70480 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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