Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3239L7N2D9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm3239L7N2D9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm3239L7N2D9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3239L7N2D9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms