Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms