Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm9602J3QPD5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm9602J3QPD5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms