Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms