Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnf4Q9QZS2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Rnf4Q9QZS2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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