Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nop56Q9D6Z1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms