Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc83Q9D4V3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms