Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lonrf3Q9D4H7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lonrf3Q9D4H7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Lonrf3Q9D4H7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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