Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpalQ9D3D0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtpalQ9D3D0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtpalQ9D3D0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtpalQ9D3D0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtpalQ9D3D0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpalQ9D3D0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms