Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smurf1Q9CUN6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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