Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms