Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nudt21Q9CQF3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms