Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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Atp6v0e1Q9CQD8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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