Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl39lQ9CQD0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms