Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pole4Q9CQ36 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pole4Q9CQ36 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pole4Q9CQ36 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pole4Q9CQ36 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pole4Q9CQ36 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Pole4Q9CQ36 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pole4Q9CQ36 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms