Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Chmp3Q9CQ10 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Chmp3Q9CQ10 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Chmp3Q9CQ10 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Chmp3Q9CQ10 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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