Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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