Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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AtrxQ61687 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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