Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms