Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms