Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pydc3Q3V3Q4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pydc3Q3V3Q4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms