Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34b4Q3V0X2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms