Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp48Q3V0C5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp48Q3V0C5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp48Q3V0C5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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