Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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